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• 1944 – 1952 – Reaparece o clube em 23 de Janeiro de 1944, depois de um interregno de dois anos.

D. Manuel Lobo da Silveira (Alvito), é eleito presidente do clube para o ano de 1944.

Amadeu Faria é eleito presidente do clube, para os anos de 1945 e 1946.

Inserido nas Festas do Junho de

1945, o Amarante Futebol Clube recebe a Associação Académica de Coimbra.

Eng. Manuel Van Zeller Macedo é eleito presidente do clube para os anos de 1947 e 1948.

Teófilo da Mota Freitas é eleito presidente do clube para o ano de 1949.

Dr. Luís Van Zeller Macedo é eleito presidente do clube para o ano de 1950.

Dr. José Soares Queiroz é eleito presidente do clube para o ano de 1951 e para a época 1952/53.

Em 1951, o Amarante Futebol Clube altera o aspecto do seu emblema.
Em 1952/53, o Amarante Futebol Clube sobe à 2ª Divisão Distrital, sagrando-se campeão da 3ª Distrital.